Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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ECM1Q16610 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ECM1Q16610 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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