Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF239Q16600 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF239Q16600 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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