Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ZFHX3Q15911 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZFHX3Q15911 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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