Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATP6AP1Q15904 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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