Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPTX1Q15818 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms