Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NR1D2Q14995 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NR1D2Q14995 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms