Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SEMA3AQ14563 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SEMA3AQ14563 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SEMA3AQ14563 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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SEMA3AQ14563 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SEMA3AQ14563 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEMA3AQ14563 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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