Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
APOFQ13790 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
APOFQ13790 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APOFQ13790 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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