Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMS2P11Q13670 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms