Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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IRF5Q13568 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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IRF5Q13568 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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IRF5Q13568 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF5Q13568 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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