Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PMS2P3Q13401 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PMS2P3Q13401 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PMS2P3Q13401 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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