Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms