Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP4Q13115 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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