Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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CHAF1BQ13112 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHAF1BQ13112 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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