Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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