Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN1Q12860 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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