Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCNH2Q12809 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms