Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CDR2Q01850 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms