Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms