Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DEFA5Q01523 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DEFA5Q01523 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms