Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 380.3 ms