Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TFAMQ00059 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms