Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELF3P78545 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELF3P78545 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms