Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEC13P55735 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEC13P55735 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms