Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDST1P52848 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDST1P52848 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDST1P52848 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDST1P52848 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NDST1P52848 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NDST1P52848 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms