Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB28P51157 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms