Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LTBRP36941 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LTBRP36941 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LTBRP36941 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms