Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYKP34925 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYKP34925 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYKP34925 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RYKP34925 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RYKP34925 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RYKP34925 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms