Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ITGA3P26006 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms