Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGFR4P22455 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms