Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHCEP18577 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHCEP18577 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms