Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EPB42P16452 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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EPB42P16452 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EPB42P16452 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPB42P16452 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms