Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NCK1P16333 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms