Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms