Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM1P13688 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms