Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COL6A2P12110 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms