Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RHOP08100 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RHOP08100 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOP08100 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOP08100 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms