Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CYBBP04839 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CYBBP04839 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYBBP04839 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYBBP04839 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CYBBP04839 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms