Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPBO95292 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPBO95292 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPBO95292 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAPBO95292 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms