Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1O95273 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms