Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRMUO75648 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms