Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSCO60682 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSCO60682 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSCO60682 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms