Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DENRO43583 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DENRO43583 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DENRO43583 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DENRO43583 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms