Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HOXA3O43365 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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