Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRTM2O43300 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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