Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KLHL33A6NCF5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms