Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ARL2-SNX15V9GYD0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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