Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SETD1BQ9UPS6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms