Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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COPS7AQ9UBW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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