Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRBP1Q9P2E9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRBP1Q9P2E9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms